扬州科教集团成立于2003年7月，前身是市政府为发展教育事业设立的教育投资集团，2020年改革重组升格为科教集团，是全省唯一以科创、教育为主营业务的市级国企平台。集团公司注册资本30亿元，职工近400人，资产总额66.63亿元、净资产21.46亿元，主体信用评级AA。
科创板块下设扬州科创发展有限公司、扬州科技招商中心有限公司，是集团科创产业发展的承载主体，肩负着推动全市及集团科创产业创新、转型升级、招商引资、发展集聚的重任。运营设立有两中心（深圳·扬州域外创新中心、扬州科技招商中心）、两基金（天使科创基金、教投科技股权基金）、三大载体（扬州创新中心、国泰科创中心、华城科技广场）。
教育板块下设扬州教育发展有限公司，作为集团教育板块的管理平台，主要承担教育产业投资、教育资本运营、教育资产管理等职能，下辖扬州科教培训中心有限公司和扬州翼立方教育文化发展有限公司两家全资子公司，同时运营管理一所中职学校、三所机关幼儿园及一所托育园。
集团是市政府明确的市级政府投资工程集中建设平台之一，负责科、教、文、卫、体、民政等社会事业设施房建类工程建设。建设板块下设科教建设公司、集中项目管理公司，其中建设公司承担市场化经营任务，对外开展工程施工维修、工程材料采销等建设业务，项目公司负责市财政集中建设工程的建设管理。2020年以来，先后承建南邮通达学院、技师学院、扬州中学树人堂等全市“两报告两文件”的重点民生项目项目30余个、总面积超60万方。
服务板块下设扬州科教服务有限公司，作为科教产业后勤服务平台，主要围绕科创、教育板块开展餐饮住宿服务、物业管理两大主营业务。目前，运营管理市残联、扬州创新中心、中航机载和沈飞601所自助餐区、扬汽集团职工餐厅、技师学院新校区、扬州职大等11家高校、科创载体、国企餐饮后勤服务。
大数据板块于2023年9月，在市委、市政府的认可下揭牌成立大数据集团，定位为全市唯一的以数据为核心业务的、具有功能保障属性的市属国有企业，首批整合了包括扬州大数据发展有限公司、扬州征信服务有限公司、“我的扬州”APP等在内的八项相关资源，重点围绕数字基础设施建设、数据运营开发、数据交易服务、数字金融赋能、数字产业投资和数据发展研究等六大方向开展业务，统筹推进全市数字产业化和产业数字化。